故事從人類文明離開太陽系后的人類歷百余年后開始。
逃離的結(jié)果
此時的人類文明主體已經(jīng)從太陽系時空網(wǎng)絡(luò)節(jié)點完成了逃離太陽系的過程，但是因為少數(shù)人對利益的執(zhí)著，分布于1900多個時空囊泡的七十萬億人類最終僅剩余4百多億。并且為了保住靈盟的重要時空囊泡，從遠古時期就留存下來的各個種族的仙人和精怪也在強行傳送天宮等重要場所的過程中遭受時空沖突而形神俱滅。
這使得人類本可以在賀蘭人組建的星際政府中占有一定地位的計劃徹底泡湯，為了利益不惜搭上全文明幾乎全部個體的惡名也讓星際政府疏遠了剩余的人類。
于是人類文明被圈禁在了“人類文明星域”。
上人（仙人）遠行
為了保持境界也為了給人類爭取機會。人類歷3年，靈盟剩余的仙人級人類和精怪前往了賀蘭文明首星。
并且，在經(jīng)歷了大逃亡后原本的混居計劃沒有了意義，靈盟幾乎解散。后按照宗教和文明體系分配了由“這個蟲族”搭建起的6個恒星系近百顆宜居行星中。
（在長者遠行開始的時候，賀蘭使者才向人類說明，其實最初計劃分配給人類的是三個星域，40余個恒星系，1700多顆宜居行星。并且擁有健全的時空網(wǎng)絡(luò)節(jié)點交通系統(tǒng)和跨時空信息網(wǎng)絡(luò)，人類完全能夠不使用飛船而直接在各個星球間使用節(jié)點網(wǎng)絡(luò)自由移動。
但是貪婪換來的是圈禁和封鎖，僅僅將經(jīng)過了“這個蟲族”改造的7個恒星系交給了人類）
方舟爭奪戰(zhàn)
人類歷12年，關(guān)于地球方舟和火星方舟以及影子方舟的歸屬權(quán)引發(fā)了內(nèi)戰(zhàn)。在賀蘭使者的關(guān)注下，內(nèi)戰(zhàn)最后演變成了擂臺賽，但參戰(zhàn)各方依然付出了巨大的傷亡。最終，東方文明天宮體系獲得了地球方舟；由上帝信仰組建成的神約體系獲得了火星方舟；影子方舟在交戰(zhàn)之初就直接進入了躍遷，直接失蹤。直到家族叛亂戰(zhàn)爭結(jié)束后，在長者遠行開始之前被賀蘭使者強行趕出了人類文明星域，后不知所蹤。
家族勢力崛起
從人類歷15年開始，由于人類文明的人口組成以現(xiàn)世和十?dāng)?shù)個與現(xiàn)代地球類似的文明為主要人口構(gòu)成，人類文明對權(quán)力和利益的玩弄依然是這個時代不可繞過的一部分。
家族官僚和資本世家開始從靈盟為主的權(quán)力核心中獲得大量的權(quán)職。一開始這些勢力做的很隱蔽，但隨著時間的延續(xù)，越來越多的權(quán)力開始向那些大家族集中，在人類歷82年時，神約星域的大家族已經(jīng)基本上掌握了該星域的行政權(quán)力，古神星域基本上被古神的世襲家族控制，而各個星域的衛(wèi)戍艦隊都有了失控的趨勢。
重塑太陽系申請獲得轉(zhuǎn)機
在家族勢力逐漸掌控人類文明星域的同時，在上人們的努力下，以賀蘭文明早期筑礦記錄為依據(jù)的舊太陽系重塑申請基本獲得允許。
但作為新加入星際政府的一個圈禁文明，也沒有為政府作出任何貢獻，最終根本沒法獲得賀蘭人的認(rèn)可。
但在觀察者（一支早于賀蘭文明進入5級文明的高級文明）的游說下，賀蘭人最終決定公開早期太陽系模板信息。但后續(xù)的資源需要人類為星際政府執(zhí)行觀察工作。
由于人類文明處于筑礦星區(qū)，人類在數(shù)千次恒星系重塑的過程中，從觀察者學(xué)到了時空囊泡的基礎(chǔ)技術(shù)，并且在生存壓力下迅速完成了時空囊泡的各項技術(shù)的積累。因此，人類文明（靈盟，不是現(xiàn)世地球）實際上擁有遠超過一個2級文明所能夠獲得的時空囊泡操控技術(shù)。在時空囊泡的相關(guān)理論和操控技術(shù)上已經(jīng)達到了準(zhǔn)4級文明的程度。
但，由于能量技術(shù)和材料技術(shù)以及宇宙時空網(wǎng)絡(luò)等一系列短板的制約下，人類空有理論和操控技術(shù)，卻沒有完成操控的能力。
但，這并不妨礙人類文明獲得了成為一個合格文明觀察者和開荒者的可能。
家族勢力危機
但在人類歷103年開始，賀蘭人開始觀察到人類文明星域的權(quán)力以及整個文明的社會整體意志開始向利益渴求轉(zhuǎn)變。
賀蘭人在行政指令體系中公開否定了上人們之前的所有努力。認(rèn)為人類從來沒有從文明毀滅中獲得教訓(xùn)，反而變本加厲，可能成為破壞星際政府運行體系的惡劣文明。
要求徹底清洗人類文明中體系中的原罪。
長者遠行計劃制定，開始物色接班人。
為了應(yīng)對賀蘭人的要求，在觀察者聯(lián)盟的斡旋下，最終以剝離人類文明中成年人和未成年人的計劃被制定。所有可能導(dǎo)致人類文明再次為了利益引發(fā)社會災(zāi)難的成年人都會在解決此次危機后被派往距人類文明星域1.2億光年外的另外一個星系群參與拓荒和觀察工作。
于是在上人們的指令性，所有舊地球和火星宗門，科學(xué)院，宗教團體重新開始制定教學(xué)綱領(lǐng)，壓制和控制家族勢力的擴張。并開始從未成年人中選擇傳承人。
家族勢力叛亂
家族勢力中部分擁有上人的世襲家族卻對家族老祖的警告置若罔聞，認(rèn)為在了解到老祖級別的人不可能參與到星域的事務(wù)中來時，更是認(rèn)定家族團體可以完全控制人類文明星域成為這個星域的掌控者。
到時候就可以建立起以家族精英團體為核心的新人類文明體系。甚至可以轉(zhuǎn)變?yōu)槿祟惖蹏?p> 此時，家族及其黨羽已經(jīng)控制了9成以上的各個星系的衛(wèi)戍艦隊，而且唯一沒有跑掉的地球方舟也被家族勢力掌握了控制權(quán)。連天宮恒星系第一艦隊除旗艦鯤鵬之外也有6成被控制。
突如其來的行政壓制讓整個家族勢力體系很不適應(yīng)，靈盟傳統(tǒng)勢力開始了對家族官僚的清理。但手段上并不激烈甚至可以說完全沒多大效果。
但對于家族勢力而言，完全不可接受，百年的鋪墊（人類歷）不能就此功虧一簣。
人類歷128年，神約第二第三艦隊突襲天宮恒星系，天宮恒星系夏，周，秦，唐，宋行星衛(wèi)戍艦隊叛變，集結(jié)艦隊保衛(wèi)首都星天宮星。地球方舟被家族勢力劫持，叛亂開始。靈盟火種計劃啟動。
火種計劃是當(dāng)確認(rèn)戰(zhàn)爭發(fā)生的時候，對選定的傳承人的撤離行動，但其中天宮星部分最重要的“炎黃號航空母艦”（舊靈盟稱其為：鯤鵬）所屬的第一艦隊也發(fā)生叛亂，天宮星火種轉(zhuǎn)移由運載機編隊自行進行。
之后在天宮時空囊泡，神約第一艦隊，天宮剩余艦隊，佛國艦隊等一應(yīng)勢力開始集結(jié)。同時“這個蟲族”太空艦隊進入天宮恒星系。各個恒星系后援封鎖了天宮恒星系回返各個恒星系的網(wǎng)絡(luò)節(jié)點。對叛軍的清洗開始。
地球方舟高位軌道強襲戰(zhàn)
在發(fā)現(xiàn)退路被封死后的家族勢力將大多數(shù)力量集中到了地球方舟，以期望利用地球方舟的自衛(wèi)火力打擊靈盟艦隊。
然后最先進入戰(zhàn)場的卻不是預(yù)想中的以鯤鵬為主的人類進攻艦隊，反而是一擁而上的蟲族先鋒。隨后靈盟主力進入戰(zhàn)場，雙方在地球方舟高位軌道開始了交戰(zhàn)
S市地核大門控制中心救援行動
S市本不適合建立地核大門，但是最后還是被建在了S市。在強襲戰(zhàn)開始的同時，靈盟的特殊部隊含修煉者和蟲族隱藏突襲蟲直接躍遷到H市上空，試圖救援和重新控制地球方舟的地核大門控制中心。避免家族勢力狗急跳墻，讓地球方舟自毀。
但是救援行動執(zhí)行得太過順利，無論是救援還是重新控制大門的行動都幾乎沒有受到阻礙。
限時強襲，地球方舟自毀倒計時，家族勢力的上人
在控制了大門，準(zhǔn)備進入地核方舟控制中心時，方舟自毀的倒計時開始了。特種部隊和蟲族需要在12小時內(nèi)奪取方舟控制中心，取消自毀工程，否則將沒有任何可能挽救地球方舟。
并且，地球方舟開始向天宮星軌道靠近。
但是直到進入控制中心外圍工事才發(fā)現(xiàn)，這里的守衛(wèi)居然全都是上人級修煉者。家族勢力叫囂著，不給他們活路就讓整個地球方舟和天宮星為其陪葬。
原來家族勢力利用他們的權(quán)力挪用和搜集了整個分散在整個星域的散碎的氣石，秘密培養(yǎng)除了一支上人部隊。無論叛亂結(jié)果如何，這都是不被允許的。這便是叛亂不得不進行的真正原因。一旦這支部隊暴露，家族勢力會被徹底毀滅。
而此時，在這個無法使用重型武器的場合下，這樣一支上人部隊幾乎就是無敵的。
直到11小時后，用一座尸山為代價，盟軍和蟲族終于啃掉了最后一個上人，進入了方舟控制中心，但負(fù)隅頑抗的家族長老團破壞了控制器，準(zhǔn)備和盟軍玉石俱焚。
賀蘭使者到來，戰(zhàn)爭結(jié)束
在家族長老團叫囂的時候，倒計時突然中止，一個晶伶（女性賀蘭人）從虛無中突然走出，舉手之間就壓制了所有殘余的家族勢力。
夂（這名賀蘭使者音譯名）的到來結(jié)束了整場戰(zhàn)爭，包括高位軌道上的戰(zhàn)艦都失去了對能量的控制，戰(zhàn)斗突然停止下來。圖像和聲音在每一個人心中泛起。
或許我們的文明之間存在巨大的不同，我們實在無法理解你們?nèi)祟愖鳛橐粋€文明卻老是為了一些利益就互相爭奪互相攻擊，這個星域那么大，完全可以容納數(shù)十倍現(xiàn)有人口，你們卻能打起一場內(nèi)戰(zhàn)。而且以你們祖輩耗盡大量生命才保存下來的星球作為代價的一部分。我們的族群和星際政府無法認(rèn)同你們的文明。
我們管理著你們口中的：拉尼娜凱亞超星系團；長蛇-半人馬超星系團；英仙-雙魚超星系團；玉夫座超新星團。數(shù)十億萬年范圍內(nèi)，智慧文明不少但也是極其稀少的。從來就沒有見過你們這樣，一開始就因為利益紛爭損耗了9成9的人口以及幾乎全部高層戰(zhàn)力，導(dǎo)致整個文明被高級文明圈禁的時候還在玩權(quán)利斗爭，試圖統(tǒng)治自己文明的。
當(dāng)然，我們也看到了，你們的種族中也有那些為了文明奮不顧身，用生命挽救你們方舟的人?；蛟S觀察者聯(lián)盟說得對，你們是一支矛盾重重的文明。星際政府通過了你們的申請，用你們成年人的辛苦去換文明的機會。
于是乎，這場打爛了人類文明近半軍力的戰(zhàn)爭就這么結(jié)束了。
長者遠行計劃被公布，父母和兒女間的告別開始了，每一個父母似乎都有說不完的囑咐，那數(shù)千個被選擇成為傳承者的熊孩子則夭壽了，開始接受強度極高的培訓(xùn)和秘密基地的權(quán)限認(rèn)證。
長者遠行，未來在于人類自己
人類歷129年剛開始的時候，地球方舟和火星方舟以及大量艦隊在賀蘭使者開啟的星門前集合，夂說出了人類上人們沒有說出來的事情：
人類因為在沖突地域的失敗導(dǎo)致整個文明被圈禁，并且失去了超過成為星際政府新代表的機會。同時也讓人類本應(yīng)獲得的星域數(shù)量和質(zhì)量大打折扣。
可以分配氣石以維持一支修煉體系的機會也同時失去，使得人類殘存的上人級個體都必須到賀蘭主星才能夠維持其境界。
并且同時告訴了人類，上級文明特別是5級文明所追求的事務(wù)。
因為對于他們這種文明而言物質(zhì)上的追求已經(jīng)沒有意義，但生存依然是一個文明必須面對的事情。
用人類的話而言：“生命生于宇宙，在宇宙中成長，也被困于宇宙受宇宙規(guī)律的限制，最終也會在宇宙的死亡中徹底消亡，而達到宇宙文明極限的文明在追求什么？自然是超脫宇宙的限制，成為虛空文明?！?p> “生命，生于斯，長于斯，困于斯，亡于斯。故，達者何求？乃可脫于斯，可生于虛空也?！?p> 成年人們就此離開。自此過去給人類留下的影響已經(jīng)盡量抹除，人類文明需要在過去的基礎(chǔ)上找尋新的道路。
未來篇結(jié)束