由于自己在戰(zhàn)爭爆發(fā)之前就將砂忍淘汰的關系，整個第三次忍界大戰(zhàn)的過程已經(jīng)面部全非。
首先，因為自己的關系，砂忍村的風影羅砂、長老千代以及主力全滅，這場以砂忍三代風影失蹤，從而對木葉發(fā)起的戰(zhàn)爭，還沒有正式開始便宣告了結束。
全村所有精銳忍者近乎全滅，風影與長老死亡，砂隱在實力上已經(jīng)跌出了五大國的等級，引得了無數(shù)想要上位的忍村的覬覦之心。
風之國也因為砂忍的戰(zhàn)敗，導致了國內(nèi)一片混亂，大名為了維護自己的統(tǒng)治，向砂忍提供了大量的資金用來幫助砂忍恢復元氣，穩(wěn)定自己的統(tǒng)治，同時也向火之國大名俯首稱臣，用以換取喘息之機。
而砂忍為了確保自己的村子不被滅了傳承，在另一位僥幸從蒼玄攻擊中活下來得砂隱長老海老藏的支持之下，由四代風影之妻加流羅繼任第五代風影，背上了無條件答應了木葉的一系列霸王條款這口大鍋之后，向木葉宣告投降。
另一邊，大野木因為眼紅木葉的收獲，聯(lián)合云隱和霧隱結成同盟，一起向木葉發(fā)起了戰(zhàn)爭，正式展開了第三次忍界大戰(zhàn)。
但結果自然不必多說，以前四打一都沒有干過木葉，沒了砂忍得掣肘，三打一之下也還是被木葉錘的慘不忍睹。
第三次忍界大戰(zhàn)初期，自信滿滿潛入火之國內(nèi)部搞暗殺的忍刀七人眾，好死不死的遇見了負責肅清火之國境內(nèi)間諜任務的波風水門小隊。
自信心膨脹的忍刀七人眾獰笑著A上去，于他們便被波風水門的飛雷神之術秀了一臉血，最終在留下了四把忍刀之后倉皇逃跑。
要不是波風水門顧忌卡卡西等三個拖油瓶，這一代的霧忍七刀估計可以除名了。
雷之國戰(zhàn)場上，由于蒼玄大幅的的改變了世界劇情，邁特凱、不知火弦間與惠比壽并沒有遇見忍刀七人眾，反而是遇見了第三代雷影。
于是護子心切邁特戴毫不猶豫的開啟了八門遁甲之陣，綻放出了血色的蓮華，以自身死亡的代價，把第三代雷影踢成了殘廢。
由于戰(zhàn)爭的原因，第三代雷影拖著重傷殘軀在與大蛇丸的戰(zhàn)斗之中強行透支生命，最終戰(zhàn)死在大蛇丸的手中，云忍士氣跌落到谷底，大蛇丸見狀對云隱發(fā)起了總攻，并且取得了大勝。
而另一邊，云隱下任領袖艾與奇拉比的AB組合，則是被前來支援的波風水門與豬鹿蝶三人組所擊敗，自己連同斷了一條手臂的八尾人柱力一同被俘獲。
雪上加霜的云隱無奈之下，以換取艾與奇拉比的代價，向木葉宣告投降。
土之國戰(zhàn)場，面對三代土影兩天秤大野木這個老對手，木葉一開始就拿出了絕大部分的實力，三代火影猿飛日斬與火影輔佐志村團藏親臨戰(zhàn)場，鏖戰(zhàn)三個月后，在正面戰(zhàn)場擊潰巖隱主力，并聯(lián)手將三代土影大野木打成重傷。
大野木眼見大勢已去，不甘的宣告投降，土之國戰(zhàn)場結束。
至于最后的水之國，除了一開始派遣忍刀七人眾前往火之國進行暗殺之外，全程幾乎一直在打醬油，眼瞅著同盟國都已經(jīng)涼了，他們自然不再堅持，果斷的宣布投降，抽身而去。
至此，第三次忍界大戰(zhàn)以不到一年的時間宣告結束，木葉再次取得了勝利，并且是大獲全勝。
其中這場戰(zhàn)爭獲益最多的不光是木葉，就連蒼玄也因此獲得了非常豐厚的收益。
世界本源的獲取方式是主神以扭曲世界軌跡的產(chǎn)生的因果來獲得，此時整個三戰(zhàn)被蒼玄魔改的面目全非，許多該死的人活了下來，該活著的人下了地獄，其中所產(chǎn)生的因果之大，獲取的世界本源之多，足以讓蒼玄什么都不做，舒舒服服的活上三千年之久。
“嘛，在休息一段時間，干一票大的就去其他的世界溜一圈！”
蒼玄靜靜的躺在床上，嘴角微微翹起，顯然是心情很好。
......
一個月后，木葉郊外，三名帶著面具的暗部，毫不掩飾自身的惡意，來到了一個簡陋的小木屋的門前，這里是蒼玄的靜養(yǎng)之地。
嘎吱......
伴隨著緩緩打開的木門，陽光直直照著這面向東面開門的小屋，露出了木屋內(nèi)部的景象，床與衣柜等必須家具外，就只有盤坐在床上的蒼玄。
“你們是誰？”
感受著來人身上那毫不掩飾的殺氣，蒼玄睜開了雙眸，一臉冷然的看向了那隱藏在面具之下，三雙散發(fā)著妖異血紅的三勾玉寫輪眼。
“鞍馬蒼玄，這是逮捕令，現(xiàn)在，你被逮捕了，如過你敢反抗的話，殺無赦！”
當先的一個宇智波上前展開一張紙，幾乎都觸到了蒼玄的鼻子，那雙寫輪眼中滿是高傲和殺意。
“可以問一下，我到底犯了什么罪嗎？”
蒼玄嘆了一口氣，著實有些不明白，他出院不過一個月的時間，而且一直待在這個小木屋里修養(yǎng)，他到底那里惹到宇智波的紅眼病了。
“哼，廢話少說，抓你還需要理由嗎！”
為首的宇智波非常囂張的大聲說道，儼然一副不把蒼玄放在心上的樣子。
你說他不知道對方的實力以及和自己的差距？
不不不，他知道，很清楚的知道，面前這位幾乎被默認為最接近千手柱間與宇智波斑的存在，他的詳細經(jīng)歷和大致能力早已在心中背的滾瓜爛熟。
他之所以表現(xiàn)的有恃無恐，一方面是因為對己方戰(zhàn)力的自信以及一點小小的蔑視，在他們看來，宇智波才是世界上最為強大的家族。
另一方面，則是拿到了蒼玄的身體數(shù)據(jù)，身體殘破不堪的蒼玄已經(jīng)失去了制造查克拉的能力，現(xiàn)在的他只是一個比普通人還不如的廢物。
所以面對這樣一個廢物，他們很難在心中升起哪怕半點的敬畏之心，盡管他之前是一個擁有毀掉一個村子強大力量的忍者。
“嘖，到底是我提不動刀了，還是你們太飄了啊?！?p> 蒼玄有些頭痛的揉了揉眉心，許是第三次忍界大戰(zhàn)木葉取得了壓倒性勝利的緣故。
木葉的人，特別是那些大家族的高傲子弟，一個個的尾巴都翹上天了，完全失去了對于強者的敬畏，即便他表現(xiàn)的只是一個廢人。
“鞍馬蒼玄，你是否認罪！”
為首的宇智波忍者不耐煩的大吼一聲，然后三人一起踏前一步，扼住了蒼玄的任何行動空間。
三人圍繞間散發(fā)出森然殺氣，其默契的配合和對戰(zhàn)機的把握遠遠超出了其余同極忍者，是名副其實的精英！