當(dāng)旗木川與雷神殘缺神格完全融合后，神而明之了其中的緣由。
明了雷鳴大陸的世界末日事件，明了雷神最后對(duì)世界的眷戀，明了神格和自己融合的始末。融合還帶來(lái)雷神對(duì)雷鳴大陸法則理解，雖然與忍者世界法則完全不同，卻也能給旗木川掌控忍者世界的法則帶來(lái)無(wú)數(shù)靈感火花。
也了解了什么是神格，神格既神之位格，它是由智慧生命體認(rèn)識(shí)世界，掌握世界運(yùn)行法則而凝聚而成。是某一項(xiàng)或多項(xiàng)世界之源的宏觀(guān)物質(zhì)體現(xiàn)，具有獨(dú)一無(wú)二的神性。所以具有神格的智慧生命體被稱(chēng)為神靈，神格不破，法則不散，則神靈不滅。
雷鳴大陸被深淵入侵，法則被深淵意志侵濁，雷神實(shí)質(zhì)化神格顯圣破滅于最終之戰(zhàn)。至此雷神被能量風(fēng)暴湮滅，實(shí)質(zhì)的神格也受到能量風(fēng)暴的洗涮，在神格即將被徹底消散之際，意外的被吸入虛空裂縫中。
而后流落火影世界，受雷遁·落雷術(shù)引導(dǎo)，進(jìn)入旗木川體內(nèi)，神格實(shí)質(zhì)化之物與未發(fā)育完全的心臟融合，成了獨(dú)特的雷神心臟，潛移默化的改造他的身體，而靈魂性質(zhì)的神性卻蟄伏在他靈魂里。。
這次穿心之劫，不僅是肉體被刺穿，神性和靈魂那最后的隔膜也被刺破。神性得與和旗木川靈魂融合，靈肉合一最終才開(kāi)啟了神格。
從神格得到的信息和結(jié)合自身狀來(lái)看，旗木川發(fā)現(xiàn)旗木家古籍對(duì)忍界傳說(shuō)來(lái)，人稱(chēng)忍者始祖的六道仙人，應(yīng)該是得到了某種神格或類(lèi)似之物，由他分出的神性。這才是查克拉的起源，這里可以看出很多事情。
首先在神話(huà)傳說(shuō)時(shí)代，可能有某種神格類(lèi)的東西改變了世界，使得這世界有了游離的神性。而某些人也得到有著容納神性的特性，并將之以基因的形式遺傳在人類(lèi)血脈中。
所以這些有著特性基因的人，在出生的時(shí)候會(huì)自動(dòng)吸取游離的對(duì)應(yīng)神性，才形成這世界特有忍者職業(yè)。所以忍者是一種另類(lèi)的神性現(xiàn)世，是這世界獨(dú)有的，是掌握神術(shù)的人，卻受限于偽神格的不完整而成不了神。
而且基因差異性，也決定了那種類(lèi)別的神性被吸收。所以出現(xiàn)忍者的屬性和血繼界限，這就是這里的基因的差異、神性差異。
可以說(shuō)只有擁有神性的人，才能讓修煉出查克拉，既成為一個(gè)忍者。所以而忍者能夠提起制造查克拉，并不是卡卡西和家族秘卷說(shuō)的那么簡(jiǎn)單。而是有了神性，才能提取能量結(jié)合精神力才有查克拉的出現(xiàn)
忍者掌控風(fēng)，火，雷，土，水，陰，陽(yáng)；使用查克拉影響自然法則，就有了這個(gè)世界的忍術(shù)，幻術(shù)，體術(shù)及其它異術(shù)。
那么所謂的忍者修行，其實(shí)就神力的提煉和神性法則的開(kāi)發(fā)。
而旗木川出生的時(shí)候，繼承的是雷神神格的神性，哪怕是殘缺而缺失了很多能力，神性也依然完整。
所以旗木川的忍者之路即是成神之路。
查克拉提煉就是神力提煉。
術(shù)的運(yùn)用就是法則的掌握。
有了法則載體，所缺的不過(guò)是神力的積累和這個(gè)世界的雷電法則掌控，當(dāng)這些完成后，旗木川就是雷神也不為過(guò)。
旗木川伸出右手虛抓握拳，低聲自語(yǔ)，那就讓我成神阻止這世間的爭(zhēng)斗吧！抬頭望向黑空，仿佛看穿虛空，就從現(xiàn)在開(kāi)始。
內(nèi)心世界沒(méi)有時(shí)間概念，當(dāng)旗木川睜開(kāi)雙眼的時(shí)候?，F(xiàn)實(shí)中霧忍才將刀抽出，剛轉(zhuǎn)過(guò)身去準(zhǔn)備去追殺被水龍擊中的卡卡西。
旗木川平靜的抬起手，撫摸了下還在流血的胸口，下一秒只見(jiàn)他由內(nèi)而外散發(fā)出一種能量波動(dòng)，胸口和其他傷口都恢復(fù)。
緊接著頭上的毛發(fā)全部變成紫色，眉間一道雷電印記鑲嵌其中。身體創(chuàng)傷恢復(fù)，穿著一身能量織就而成的紫色戰(zhàn)袍，戰(zhàn)袍上電蛇游走，顯得華麗而高貴。
雷神模式
在現(xiàn)實(shí)中，旗木川也變成了意識(shí)空間被他稱(chēng)為雷神模式的模樣。這是雷神神性結(jié)合這個(gè)世界法則的外在表現(xiàn)，在這模式下，雷電術(shù)的運(yùn)用和忍術(shù)的威力將大大提升，但缺點(diǎn)是這需要龐大的查克拉支撐。
現(xiàn)在能進(jìn)入這個(gè)模式，是過(guò)去一段時(shí)間，雷神心臟，已經(jīng)積累的好的。而且第一次使用，能量利用率太低了，加上治療和恢復(fù)身體已經(jīng)用掉大半，還能運(yùn)用這模式的時(shí)間估計(jì)也就3分鐘。
所以旗木川也不拖拉，身上氣勢(shì)再一次爆發(fā)。掌控這世間雷電的力量，首次張開(kāi)了它的爪牙。超越血繼限界與血繼淘汰的力量，在周?chē)纬梢粋€(gè)個(gè)紫色雷電球。
雷神查克拉模式下，旗木川被這些紫色的雷電球包圍，這些閃電如溫順的寵物，圍繞著旗木川打轉(zhuǎn)，而雷電和空氣激發(fā)長(zhǎng)生的滋滋聲音，猶如撒嬌聲?？此茻o(wú)害，其實(shí)具有強(qiáng)大的破壞力。
霧忍也被這背后突然爆發(fā)的查克拉嚇了一跳，全都顧不得在追殺卡卡西，轉(zhuǎn)過(guò)身來(lái)防御。他們看眼前旗木川有些愣神，他不是已經(jīng)心臟被刺穿死了嗎，怎么還會(huì)活過(guò)來(lái)，而且這種肉眼可見(jiàn)的查克拉也太可怕了。
兩人對(duì)望一眼，都從中看到了恐懼和退卻，然后就果斷的分開(kāi)逃離。剛才用刀刺穿旗木川心臟的，有點(diǎn)懷疑再次回過(guò)頭看向旗木川。見(jiàn)他還在原地不動(dòng)，定定的看著自己，感受到那眼神，不由的心里打顫。忙轉(zhuǎn)頭避開(kāi)，卻突然嚇得呆立不動(dòng)，原來(lái)他前面竟然出現(xiàn)了另一個(gè)旗木川。
原來(lái)旗木川在他回頭的時(shí)候，以如同瞬移般的速度追上霧忍，如本能般伸出右手虛握；
雷遁·雷神之刃
頃刻之間，本來(lái)圍繞他的那些紫色雷電光球匯聚而來(lái)，在手中形成一把紫色太刀。順勢(shì)斬了過(guò)去，霧忍反應(yīng)可謂快速，立刻拿刀格擋，卻也被旗木川雷神之刃一個(gè)劈斬，連人帶刀一起給劈成了兩半。
而此時(shí)剩下的另一忍者，也回頭看到同伴被殺后，旗木川追向自己，不由得冷汗直流。心想著，開(kāi)玩笑吧！怎么可能有這樣的怪物啊！
雷遁·雷神之鞭
就快要追上最后一個(gè)忍者的時(shí)候，旗木川手中的雷神之刃變成長(zhǎng)鞭，向前方盤(pán)卷而去。霧忍跳躲，卻被纏住了小腿，接著就被電暈過(guò)去。
旗木川抓住他后，不敢把查克拉用完，就解除了雷神模式。感受著失去力量的虛弱感，不由有些不適應(yīng)。
細(xì)細(xì)體感了這次雷神模式，旗木川知道只有再次將查克拉填充好雷神心臟，才能再使用雷神模式，或許以后查克拉多了，可以隨時(shí)的、更久的使用雷神，現(xiàn)在三天內(nèi)是用不出了，
旗木川將昏迷的霧忍四肢捆綁好，在湖邊找到了昏迷過(guò)去的卡卡西，還好沒(méi)受很大的傷，只是被水龍撞暈了。
于是旗木川就帶著兩個(gè)昏迷的人回木葉了，現(xiàn)在他也只能先回村，向四代求援并拷問(wèn)這個(gè)霧忍，才能救出琳姐姐。